-
non-homogeneous dynamic bayesian networks with bayesian regularization for inferring gene regulatory networks with gradually time-varying structure
جزئیات بیشتر مقاله- تاریخ ارائه: 1392/07/24
- تاریخ انتشار در تی پی بین: 1392/07/24
- تعداد بازدید: 1138
- تعداد پرسش و پاسخ ها: 0
- شماره تماس دبیرخانه رویداد: -
the proper functioning of any living cell relies on complex networks of gene regulation. these regulatory interactions are not static but respond to changes in the environment and evolve during the life cycle of an organism. a challenging objective in computational systems biology is to infer these time-varying gene regulatory networks from typically short time series of transcriptional profiles. while homogeneous models, like conventional dynamic bayesian networks, lack the flexibility to succeed in this task, fully flexible models suffer from inflated inference uncertainty due to the limited amount of available data. in the present paper we explore a semi-flexible model based on a piecewise homogeneous dynamic bayesian network regularized by gene-specific inter-segment information sharing. we explore different choices of prior distribution and information coupling and evaluate their performance on synthetic data. we apply our method to gene expression time series obtained during the life cycle of drosophila melanogaster, and compare the predicted segmentation with other state-of-the-art techniques. we conclude our evaluation with an application to synthetic biology, where the objective is to predict an in vivo regulatory network of five genes insaccharomyces cerevisiae subjected to a changing environment.
مقالات جدیدترین رویدادها
-
استفاده از تحلیل اهمیت-عملکرد در ارائه الگوی مدیریت خلاقیت سازمانی و ارائه راهکار جهت بهبود
-
بررسی تاثیر ارزش وجوه نقد مازاد بر ساختار سرمایه شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر سطح افشای ریسک بر قرارداد بدهی شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر رتبه بندی اعتباری مبتنی بر مدل امتیاز بازار نوظهور بر نقد شوندگی سهام با تأکید بر خصوصی سازی شرکت ها
-
تأثیر آمیخته بازاریابی پوشاک ایرانی بر تصویر ذهنی مشتری پوشاک ایرانی (هاکوپیان)
-
بررسی نقش فیبرینوژن در ارتباط احتمالی عفونت هلیکوباکترپیلوری با بیماری های ایسکمیک قلبی
-
بررسی تاثیر الیاف پلی پروپیلن بر بتن خود تراکم حاوی دوده سیلیس و خاکستر پوسته شلتوک برنج
-
مقایسه سطح استرس در دانش آموزان موفق و ناموفق ابتدایی منطقه بزینه رود
-
بررسی تاثیر سرمایه گذاری در بازاریابی رابطه مند بر قدرشناسی و رضایتمندی مشتری در فروشگاه های زنجیره ای شهروند شهر تهران
-
آموزش خلاقانه سازه به دانشجویان معماری با تکیه بر سازه های طبیعی
مقالات جدیدترین ژورنال ها
-
مدیریت و بررسی افسردگی دانش آموزان دختر مقطع متوسطه دوم در دروان کرونا در شهرستان دزفول
-
مدیریت و بررسی خرد سیاسی در اندیشه ی فردوسی در ادب ایران
-
واکاوی و مدیریت توصیفی قلمدان(جاکلیدی)ضریح در موزه آستان قدس رضوی
-
بررسی تاثیر خلاقیت، دانش و انگیزه کارکنان بر پیشنهادات نوآورانه کارکنان ( مورد مطالعه: هتل های 3 و 4 ستاره استان کرمان)
-
بررسی تاثیر کیفیت سیستم های اطلاعاتی بر تصمیم گیری موفق در شرکتهای تولیدی استان اصفهان (مورد مطالعه: مدیران شرکتهای تولیدی استان اصفهان)
-
مقایسه تعالی عملکرد سازمان های کوچک و بزرگ با رویکرد efqm
-
ارزیابی آمادگی الکترونیکی شهرداری تهران
-
بررسی و مقایسه تکنیک های مبتنی برمنطق فازی جهت بهینه سازی مصرف انرژی در شبکه های حسگر بی سیم
-
کاربرد تئوری مبتنی بر عامل در طراحی پوسـته های هوشمند
-
تاثیر نماز و نیایش در تقویت ابعاد معنوی انسان
سوال خود را در مورد این مقاله مطرح نمایید :