• روش هوشمند پیش بینی توالی زمانی بیان ژن ها مبتنی بر شبکه های فازی – عصبی پویا

    جزئیات بیشتر مقاله
    • تاریخ ارائه: 1392/07/24
    • تاریخ انتشار در تی پی بین: 1392/07/24
    • تعداد بازدید: 1283
    • تعداد پرسش و پاسخ ها: 0
    • شماره تماس دبیرخانه رویداد: -
    از آن جا که فرآیند تنظیم ژن ها در سطح سلولی یک روند دینامیک و پویا است، شبکه های عصبی با قابلیت آموزش و تنظیم براساس داده های آموزشی و سیستم های فازی با قابلیت تفسیرپذیری، الگوریتم های مناسبی جهت این نوع محاسبات هستند. در پژوهش پیش روی، روش هایی بر مبنای شبکه های عصبی فازی جهت پیش بینی ارتباطات پیچیده میان ژن ها انجام شده است. روش پیشنهادی، ژن هایی که بیشترین تاثیر بر هم دارند را به عنوان ژن های تنظیم کننده می یابد و نوع روابط آنها شامل اثر سد کنندگی، فعال کنندگی و یا خنثی را مشخص می کند و در نهایت شبکه تنظیم ژنی ترسیم می شود. برای آموزش، از مجموعه داده های استاندارد ریزآرایه مربوط به 12 ژن شاخص موثر در مدت سیکل جوانه زدن نوعی مخمر (saccharomyces cerevisiae) استفاده شد. فعل و انفعالات حاصل شده با نتایج آزمایشگاهی بیولوژیکی پیشین، تحت معتبرسازی قرار گرفته اند و نتایج نشان دهنده آن است که با اجرای روش پیشنهادی، 15% از تعداد قوانین استخراج شده جهت بخش بندی فضای ورودی – خروجی کاسته شده و این منجر به کاهش شدید محاسبات می شود، در حالی که میزان مجموع مربعات خطای الگوریتم نیز در مقایسه با نزدیک ترین روش از لحاظ الگوریتم، -0.3 کاهش یافته است.

سوال خود را در مورد این مقاله مطرح نمایید :

با انتخاب دکمه ثبت پرسش، موافقت خود را با قوانین انتشار محتوا در وبسایت تی پی بین اعلام می کنم
مقالات جدیدترین رویدادها