• مقایسه روش های مختلف مکان یابی ژن ها (qtl) با استفاده از داده های شبیه سازی شده

    نویسندگان :
    جزئیات بیشتر مقاله
    • تاریخ ارائه: 1391/03/31
    • تاریخ انتشار در تی پی بین: 1391/03/31
    • تعداد بازدید: 1277
    • تعداد پرسش و پاسخ ها: 0
    • شماره تماس دبیرخانه رویداد: -
    علی رغم موفقیت های زیاد در مطالعات ژئومیکس (gwas) هنوز هم چالش هایی در شناسایی qlt وجود دارد، به ویژه برای داده هایی که سطوح مختلف ارتباطات ژنتیکی مختلف در بین مارکرها و حیوانات مورد مطالعه وجود دارد. در مطالعه اخیر، سه روش مختلف مطالعات ژئومیکس بر داده های شبیه سای شده مورد بررسی قرار گرفت 1) مدل تک مارکری 2) هاپلوتیپ تصادفی و 3) مدل بیز. داده های شبیه سازی شده شامل 2000 حیوان حاصل از 20 فامیل ناتنی پدری و داده های ژنوتیپی شامل snp 9990 بر روی 5 کروموزوم می باشد. طول هر کروموزوم 100 cm در نظر گرفته شد و مارکرها در فواصل یکسانی از هم قرار دارند. هشت qlt بر روی کروموزوم های 1 تا 5 شبیه سازی شد. سه مدل مورد استفاه شامل تک مارکری، هاپلوتیپ تصادفی و بیز به ترتیب 6، 6 و 7 تا از 8 qlt شبیه سازی شده را شناسایی نمود. از بین روش های فوق مدل بیز بالاترین قدرت در تشخیص qlt را دارا است اما دارای یک خطا نیز در تعیین qlt بود (false negative). استفاده از مدل های مختلف مطالعات ژنومیکس، می تواند موجب اطمینان بیشتر در شناسایی qlt گردد.

سوال خود را در مورد این مقاله مطرح نمایید :

با انتخاب دکمه ثبت پرسش، موافقت خود را با قوانین انتشار محتوا در وبسایت تی پی بین اعلام می کنم
مقالات جدیدترین رویدادها