• تجزیه جایگاه های ژنی (qtl) با مدل هاپلوتیپ تصادفی و تاثیر طول هاپلوتیپ در تشخیص مکان های ژنی صحیح

    جزئیات بیشتر مقاله
    • تاریخ ارائه: 1391/03/31
    • تاریخ انتشار در تی پی بین: 1391/03/31
    • تعداد بازدید: 1056
    • تعداد پرسش و پاسخ ها: 0
    • شماره تماس دبیرخانه رویداد: -
    تحقیق حاضر به منظور تجزیه مکان های ژنی (qtl) با مدل هاپلوتیپ تصادفی در یک جمعیت شبیه سازی انجام گرفت. جمعیت شبیه سازی شده در آخرین نسل شامل 2000 حیوان حاصل از 20 فامیل ناتنی پدری بود که هر کدام ار والدهای نر با 15 والد ماده آمیزش داده شده و از فامیل تنی 15 نتایج حاصل شده است منتهی فقط 10 نتایج آنها دارای رکورد فنوتیپی هستند. داده های ژنوتیپی شامل snp 9990 توزیع شده بر روی 5 کروموزوم که هر کروموزوم دارای طول 100 سانتی مورگان می باشد و مارکر به فاصله یکسانی از هم قرار دارند. در ژنوم qtl 8 شبیه سازی شد که به ترتیب 1، 2، 2، 1 و 2 بر روی کروموزوم های 1 تا 5 است. مدل هاپلوتیپ تصادفی با طول ها مختلف شامل 2، 3، 4، 5، 6، 7، 8 و 12 نوکلوئید بر روی داده های فوق اجرا گردید. مدل هاپلوتیپ تصادفی در تشخیص صحیح جایگاه های qtl شبیه سازی شده قوی بود و توانست 7 تا از qtl 8 شبیه سازی شده را با دقت بالا و در دامنه کمتر از 2 سانتی مورگان از محل اصلی شناسایی نماید. مدل هاپلوتیپ با 5 نوکلئوتید بیشترین دقت در شناسایی دقیق qtl اصلی و کمترین تعداد خطا را دارا بود.

سوال خود را در مورد این مقاله مطرح نمایید :

با انتخاب دکمه ثبت پرسش، موافقت خود را با قوانین انتشار محتوا در وبسایت تی پی بین اعلام می کنم
مقالات جدیدترین رویدادها
مقالات جدیدترین ژورنال ها