جداسازی و همسانه سازی ژن کد کننده پروتئین غیرفعال کننده ریبوزومی نوع دو از خربزه (cucumis melo)

پروتئین های غیرفعال کننده ریبوزوم (rip) یکی از این مکانیسم های دفاعی است که گیاهان برای مقابله با تنش های زیستی بکار می برند. گیاهان خانواده کدوئیان دارای طیف گستردهای از این پروتئین ها می باشند. در تحقیق حاضر یک rip نوع دو از خربزه (cucumis melo) با استفاده از پرایمرهای اختصاصی جداسازی و پس از همسانه سازی در ناقل، تعیین توالی شد. میزان مشابهت این توالی با سایر rip های نوع دو بررسی شد و بیش ترین میزان مشابهت را با توالی rip خربزه ثبت شده در پایگاه داده بانک ژن با 97 درصد مشابهت در توالی پروتئینی نشان داد. کم ترین میزان مشابهت این توالی با جو (hordeum vulgare) به میزان تنها 2.6 درصد بود. با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی متعدد خصوصیات فیزیکوشیمیایی و ساختاری پروتئین جداسازی شده تعیین و با سایر rip ها مقایسه شد. بر اساس نتایج بدست آمده بنظر می رسد ارقام مختلف خربزه از نظر توالی و ساختار پروتئینی rip ممکن است با هم تفاوت داشته باشند که روی پاسخ آن ها به تنش های زیستی تاثیرگذار خواهد بود.