بررسی وضعیت bottleneck در نمونه ای از جمعیت کبک ایرانی با استفاده از آنالیز ریز ماهواره ها

در این تحقیق از 120 قطعه کبک بطور تصادفی خونگیری و با استفاده از روش نمکی استخراج dna صورت گرفت. جایگاه های مورد استفاده عبارت بودند از aru 1k10,aru 1g49, aru1l 125, aru1e7, aru1e93, aru 1f25, aru 1d39, aru 1a1 که پس از بهینه سازی pcr الکتروفورز محصولات آن بر روی ژل اکریل آمید، رنگ آمیزی به روش نیترات نقره انجام شد و تعیین ژنوتیپ صورت گرفت. داده های آماری با استفاده از نرم افزارهای genalex ,popgeneمورد آنالیز و همچنین جهت برآورد میزان باتلنک از نرم افزار bottleneck استفاده گردید. تعادل هاردی واینبرگ با آزمون مربع کای x²t بدست آمد. در کل جمعیت تمامی مکانهای ژنی مورد مطالعه از تعادل فوق انحراف معنی داری نشان دادند (p<0.05). بیشترین و کمترین تعداد الل مشاهده شده به ترتیب مربوط به جایگاه های aru1g49 با 21 الل و aru 1k10 با 4 الل بود. میانگین فراوانی اللی (na)، شاخص شانون و pic، به ترتیب 0.7092 ,1.8283 ,9.333 بود. تنوع درون جمعیتی بر اساس آنالیز مقادیر هتروزایگوسیتی بررسی شد که میانگین هتروزایگوسیتی مشاهده شده 0.203 و میانگین هتروزایگوسیتی مورد انتظار نااریب در این جمعیت 0.797 بود. تعداد مورد انتظار جایگاههای با فزونی هتروزایگوسیتی با استفاده از مدل tpm ,iam به ترتیب 3.56 و 3.54 بدست آمد. مقادیر احتمالات نیز در این دو مدل به ترتیب 0.4331 و 0.04228 محاسبه شد که بر اساس آن می توان گفت bottleneck اتفاق نیفتاده است.