محبوبترین نویسندگان :
نویسندگان مقالات پربازدید :
نوزدهمین کنفرانس ملی سالانه انجمن کامپیوتر ایران
جزئیات رویداد
همایش ، رویداد ، ژورنال
اینستاگرام تی پی بین
حوزه های تحت پوشش رویداد

  • پیش بینی عملکرد پروتئین ها با استفاده از الگوریتم درخت تصمیم با فرض ناسازگار بودن کلاس های عملکردی نمونه ها

    نویسندگان :
    کلمات کلیدی :
    جزئیات بیشتر مقاله
    • تاریخ ارائه: 1392/07/24
    • تاریخ انتشار در تی پی بین: 1392/07/24
    • تعداد بازدید: 1811
    • تعداد پرسش و پاسخ ها: 0
    • شماره تماس دبیرخانه رویداد: -
    پیش بینی عملکرد پروتئین ها (pfp) یکی از مسائل محاسباتی پیچیده به حساب می آید که در آن، هر پروتئین می تواند همزمان به بیش از یک کلاس عملکردی تعلق داشته باشد، هم چنین، کلاس ها در یک ساختار سلسله مراتبی به فرم درخت یا گراف جهت دار بدون دور سازماندهی می شوند. بنابراین، الگوریتم های مورد استفاده برای حل این مسأله، باید قادر به شناسایی همه ی کلاس های عملکردی یک پروتئین باشند و از طرفی سازگاری بین کلاس های عملکردی را حفظ کنند. بسیاری از الگوریتم های پیشنهادی، به منظور حفظ سازگاری کلاس های پیش بینی شده، به سادگی طی یک مرحله پیش پردازش، ناسازگاری های موجود بین کلاس های نمونه های آموزشی را رفع کرده و با فرض سازگار بودن مجموعه داده آموزشی، سازگاری کلاس های پیش بینی شده را تضمین می کنند. این راه حل، احتمال انتشار خطا را افزایش می دهد. این مقاله برای حل مسأله pfp، یک راه حل دو لایه ای ترکیبی را پیشنهاد می کند که با فرض ناسازگار بودن کلاس های عملکردی نمونه های آموزشی، سعی در پیش بینی کلاس های عملکردی سازگار برای یک نمونه جدید دارد. نتایج ارزیابی الگوریتم بر روی دو مجموعه داده چند برچسبی و سلسله مراتبی cellcycle و derisi که با استفاده از اطلاعات داده های بیان ژن، عملکرد پروتئین ها را در دو نسخه funcat و go بیان می کنند، برتری روش پیشنهادی را نسبت به روش های موجود، به وضوح نشان می دهد.

سوال خود را در مورد این مقاله مطرح نمایید :

با انتخاب دکمه ثبت پرسش، موافقت خود را با قوانین انتشار محتوا در وبسایت تی پی بین اعلام می کنم
مقالات جدیدترین رویدادها
مقالات جدیدترین ژورنال ها