-
a yeast phenomic model for the gene interaction network modulating cftr-δf508 protein biogenesis
جزئیات بیشتر مقاله- تاریخ ارائه: 1392/07/24
- تاریخ انتشار در تی پی بین: 1392/07/24
- تعداد بازدید: 1016
- تعداد پرسش و پاسخ ها: 0
- شماره تماس دبیرخانه رویداد: -
background: the overall influence of gene interaction in human disease is unknown. in cystic fibrosis (cf) a singleallele of the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (cftr-δf508) accounts for most of the disease. incell models, cftr-δf508 exhibits defective protein biogenesis and degradation rather than proper trafficking to theplasma membrane where cftr normally functions. numerous genes function in the biogenesis of cftr andinfluence the fate of cftr-δf508. however it is not known whether genetic variation in such genes contributes todisease severity in patients. nor is there an easy way to study how numerous gene interactions involving cftr-δfwould manifest phenotypically. methods: to gain insight into the function and evolutionary conservation of a gene interaction network thatregulates biogenesis of a misfolded abc transporter, we employed yeast genetics to develop a ‘phenomic’ model,in which the cftr-δf508-equivalent residue of a yeast homolog is mutated (yor1-δf670), and where the genomeis scanned quantitatively for interaction. we first confirmed that yor1-δf undergoes protein misfolding and hasreduced half-life, analogous to cftr-δf. gene interaction was then assessed quantitatively by growth curves forapproximately 5,000 double mutants, based on alteration in the dose response to growth inhibition by oligomycin,a toxin extruded from the cell at the plasma membrane by yor1. results: from a comparative genomic perspective, yeast gene interactions influencing yor1-δf biogenesis wererepresentative of human homologs previously found to modulate processing of cftr-δf in mammalian cells.additional evolutionarily conserved pathways were implicated by the study, and a δf-specific pro-biogenesisfunction of the recently discovered er membrane complex (emc) was evident from the yeast screen. this novelfunction was validated biochemically by sirna of an emc ortholog in a human cell line expressing cftr-δf508. the precision and accuracy of quantitative high throughput cell array phenotyping (q-htcp), which captures tensof thousands of growth curves simultaneously, provided powerful resolution to measure gene interaction on aphenomic scale, based on discrete cell proliferation parameters. conclusion: we propose phenomic analysis of yor1-δf as a model for investigating gene interaction networks thatcan modulate cystic fibrosis disease severity. although the clinical relevance of the yor1-δf gene interactionnetwork for cystic fibrosis remains to be defined, the model appears to be informative with respect to human cellmodels of cftr-δf. moreover, the general strategy of yeast phenomics can be employed ina systematic manner
مقالات جدیدترین رویدادها
-
استفاده از تحلیل اهمیت-عملکرد در ارائه الگوی مدیریت خلاقیت سازمانی و ارائه راهکار جهت بهبود
-
بررسی تاثیر ارزش وجوه نقد مازاد بر ساختار سرمایه شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر سطح افشای ریسک بر قرارداد بدهی شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر رتبه بندی اعتباری مبتنی بر مدل امتیاز بازار نوظهور بر نقد شوندگی سهام با تأکید بر خصوصی سازی شرکت ها
-
تأثیر آمیخته بازاریابی پوشاک ایرانی بر تصویر ذهنی مشتری پوشاک ایرانی (هاکوپیان)
-
مطالعه قیاسی بین روش های بهینه سازی خرپا با تحلیل به روش نیرو و تحت بارگذاری های استاتیکی و دینامیکی
-
ارزیابی ریسک پروژه های تونل سازی مکانیزه به روش تحلیل سلسله مراتبی-مطالعه موردی: تونل انتقال آب سد دز در استان خوزستان
-
الگوها و روش های جدید در تدریس دوره دبستان
-
سنجش میزان رضامندی مددجویان از خدمات توانبخشی جمعیت هلال احمر شهر تهران
-
e-unification with constants vs. general e-unification
مقالات جدیدترین ژورنال ها
-
مدیریت و بررسی افسردگی دانش آموزان دختر مقطع متوسطه دوم در دروان کرونا در شهرستان دزفول
-
مدیریت و بررسی خرد سیاسی در اندیشه ی فردوسی در ادب ایران
-
واکاوی و مدیریت توصیفی قلمدان(جاکلیدی)ضریح در موزه آستان قدس رضوی
-
بررسی تاثیر خلاقیت، دانش و انگیزه کارکنان بر پیشنهادات نوآورانه کارکنان ( مورد مطالعه: هتل های 3 و 4 ستاره استان کرمان)
-
بررسی تاثیر کیفیت سیستم های اطلاعاتی بر تصمیم گیری موفق در شرکتهای تولیدی استان اصفهان (مورد مطالعه: مدیران شرکتهای تولیدی استان اصفهان)
-
طراحی و تحلیل گشتاور در پیچ پروانه ای و مقایسه آن با ستاره ای
-
بررسی مفاهیم زیبایی، والایی و هنر زیبا با اتکا به مفهوم سوژه و ابژه از منظر کانت
-
تاثیر مسئولیت پذیری اجتماعی و عدم اطمینان محیطی بر عملکرد مالی شهرداری های استان مرکزی
-
بررسی تأثیر کیفیت حاکمیت شرکتی بر رابطه بین سطح هزینه بدهی و مازاد بازده در شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
تشخیص ورشکستگی شخصی فرامرزی در سنگاپور (ارزیابی انتقادی نقش قوانین بین المللی و مشکلات آن) به همراه مقایسه قوانین ایران و سنگاپور در این خصوص
سوال خود را در مورد این مقاله مطرح نمایید :