-
the dependence of dna supercoiling on solution electrostatics
جزئیات بیشتر مقاله- تاریخ ارائه: 1392/01/01
- تاریخ انتشار در تی پی بین: 1392/01/01
- تعداد بازدید: 614
- تعداد پرسش و پاسخ ها: 0
- شماره تماس دبیرخانه رویداد: -
we develop an elastic–isotropic rod model for twisted dna in the plectonemic regime. we account for dna elasticity, electrostatic interactions and entropic effects due to thermal fluctuations. we apply our model to single-molecule experiments on a dna molecule attached to a substrate at one end, while subjected to a tensile force and twisted by a given number of turns at the other end. the free energy of the dna molecule is minimized subject to the imposed end rotations. we compute values of the torsional stress, radius, helical angle and key features of the rotation–extension curves. we also include in our model the end loop energetic contributions and obtain estimates for the jumps in the external torque and extension of the dna molecule seen in experiments. we find that, while the general trends seen in experiments are captured simply by rod mechanics, the details can be accounted for only with the proper choice of electrostatic and entropic interactions. we perform calculations with different ionic concentrations and show that our model yields excellent fits to mechanical data from a large number of experiments. our methods also allow us to consider scenarios where we have multiple plectonemes or a series of loops forming in the dna instead of plectonemes. for a given choice of electrostatic and entropic interactions, we find there is a range of forces in which the two regimes can coexist due to thermal motion.
مقالات جدیدترین رویدادها
-
استفاده از تحلیل اهمیت-عملکرد در ارائه الگوی مدیریت خلاقیت سازمانی و ارائه راهکار جهت بهبود
-
بررسی تاثیر ارزش وجوه نقد مازاد بر ساختار سرمایه شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر سطح افشای ریسک بر قرارداد بدهی شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر رتبه بندی اعتباری مبتنی بر مدل امتیاز بازار نوظهور بر نقد شوندگی سهام با تأکید بر خصوصی سازی شرکت ها
-
تأثیر آمیخته بازاریابی پوشاک ایرانی بر تصویر ذهنی مشتری پوشاک ایرانی (هاکوپیان)
-
بررسی تغییرمکان های ایجادشده در توده های سنگی مختلف بر اثر حفر تونل، با استفاده از روش های عددی
-
مقایسه رشد اجتماعی در دانش آموزان پسر پایه پنجم ابتدایی مدارس هوشمند و سنتی
-
تحلیلی بر شاخص های توسعه کشاورزی و تعیین درجه توسعه یافتگی شهرستان های استان خوزستان
-
محاسبه ی رشد بهره وری با استفاده از مدل تلفیقی تحلیل پوششی داده و شاخص تورنکوئیست در شرکت گاز استان س و ب
-
effects of vertical irregularities on seismic shear demands of columns in steel moment frames
مقالات جدیدترین ژورنال ها
-
مدیریت و بررسی افسردگی دانش آموزان دختر مقطع متوسطه دوم در دروان کرونا در شهرستان دزفول
-
مدیریت و بررسی خرد سیاسی در اندیشه ی فردوسی در ادب ایران
-
واکاوی و مدیریت توصیفی قلمدان(جاکلیدی)ضریح در موزه آستان قدس رضوی
-
بررسی تاثیر خلاقیت، دانش و انگیزه کارکنان بر پیشنهادات نوآورانه کارکنان ( مورد مطالعه: هتل های 3 و 4 ستاره استان کرمان)
-
بررسی تاثیر کیفیت سیستم های اطلاعاتی بر تصمیم گیری موفق در شرکتهای تولیدی استان اصفهان (مورد مطالعه: مدیران شرکتهای تولیدی استان اصفهان)
-
عوامل تعیین کننده در محدودیت های بودجه بندی در بیمارستان های دولتی
-
اختیارات دادستان دیوان کیفری بین المللی در تعقیب جنایات بین المللی
-
سقف شیشه ای، از چالش ها و راهکارها تا توانمندسازی زنان
-
بررسی نظام داوری در قراردادهای تجاری بین المللی با رویکرد شرکت های سرمایه گذاری خارجی در ایران
-
an in-depth evaluation of micro-surfacing treatment
سوال خود را در مورد این مقاله مطرح نمایید :