-
cancer detection and biopsy classification using concurrent histopathological and metabolomic analysis of core biopsies
جزئیات بیشتر مقاله- تاریخ ارائه: 1392/07/24
- تاریخ انتشار در تی پی بین: 1392/07/24
- تعداد بازدید: 1136
- تعداد پرسش و پاسخ ها: 0
- شماره تماس دبیرخانه رویداد: -
background: metabolomics, the non-targeted interrogation of small molecules in a biological sample, is an ideal technology for identifying diagnostic biomarkers. current tissue extraction protocols involve sample destruction precluding additional uses of the tissue. this is particularly problematic for high value samples with limited availability, such as clinical tumor biopsies that require structural preservation to histologically diagnose and gauge cancer aggressiveness. to overcome this limitation and increase the amount of information obtained from patient biopsies, we developed and characterized a workflow to perform metabolomic analysis and histological evaluation on the same biopsy sample. methods: biopsies of ten human tissues (muscle, adrenal gland, colon, lung, pancreas, small intestine, spleen,stomach, prostate, kidney) were placed directly in a methanol solution to recover metabolites, precipitate proteins, and fix tissue. following incubation, biopsies were removed from the solution and processed for histology. kidney and prostate cancer tumor and benign biopsies were stained with hemotoxylin and eosin and prostate biopsies were subjected to pin-4 immunohistochemistry. the methanolic extracts were analyzed for metabolites on gc/ms and lc/ms platforms. raw mass spectrometry data files were automatically extracted using an informatics system that includes peak identification and metabolite identification software.results: metabolites across all major biochemical classes (amino acids, peptides, carbohydrates, lipids, nucleotides, cofactors, xenobiotics) were measured. the number (ranging from 260 in prostate to 340 in colon) and identity of metabolites were comparable to results obtained with the current method requiring 30 mg ground tissue. comparing relative levels of metabolites, cancer tumor from benign kidney and prostate biopsies could be distinguished. successful histopathological analysis of biopsies by chemical staining (hematoxylin, eosin) and antibody binding (pin-4, in prostate) showed cellular architecture and immunoreactivity were retained. conclusions: concurrent metabolite extraction and histological analysis of intact biopsies is amenable to the clinical workflow. methanol fixation effectively preserves a wide range of tissues and is compatible with chemical staining and immunohistochemistry. the method offers an opportunity to augment histopathological diagnosis and tumor classification with quantitative measures of biochemicals in the same tissue sample. since certain biochemicals have been shown to correlate with disease aggressiveness, this method should prove valuable as an adjunct to differentiate cancer aggressiveness.
مقالات جدیدترین رویدادها
-
استفاده از تحلیل اهمیت-عملکرد در ارائه الگوی مدیریت خلاقیت سازمانی و ارائه راهکار جهت بهبود
-
بررسی تاثیر ارزش وجوه نقد مازاد بر ساختار سرمایه شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر سطح افشای ریسک بر قرارداد بدهی شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر رتبه بندی اعتباری مبتنی بر مدل امتیاز بازار نوظهور بر نقد شوندگی سهام با تأکید بر خصوصی سازی شرکت ها
-
تأثیر آمیخته بازاریابی پوشاک ایرانی بر تصویر ذهنی مشتری پوشاک ایرانی (هاکوپیان)
-
ویژگی های زمین شناسی و دگرسانی کانه زائی رگ های چندفلزی هجیب، جنوب قزوین
-
تاثیر مولفه های سرمایه روانشناختی (تاب آوری و امیدواری) بر خستگی تحصیلی با نقش واسطه ای خودکارآمدی و وجدان تحصیلی
-
تاثیر روزه رمضان بر بهداشت روان و افسردگی دانشجویان دانشگاه آزاد اسلامی واحد سیرجان در سال 1383
-
uni-axial and multi-axial creep behaviour of p91-type steel under constant load
-
evaluation of kinematic bending moment of piles subjected to seismic motions
مقالات جدیدترین ژورنال ها
-
مدیریت و بررسی افسردگی دانش آموزان دختر مقطع متوسطه دوم در دروان کرونا در شهرستان دزفول
-
مدیریت و بررسی خرد سیاسی در اندیشه ی فردوسی در ادب ایران
-
واکاوی و مدیریت توصیفی قلمدان(جاکلیدی)ضریح در موزه آستان قدس رضوی
-
بررسی تاثیر خلاقیت، دانش و انگیزه کارکنان بر پیشنهادات نوآورانه کارکنان ( مورد مطالعه: هتل های 3 و 4 ستاره استان کرمان)
-
بررسی تاثیر کیفیت سیستم های اطلاعاتی بر تصمیم گیری موفق در شرکتهای تولیدی استان اصفهان (مورد مطالعه: مدیران شرکتهای تولیدی استان اصفهان)
-
بررسی میزان رضایت شغلی کارکنان شهرداری بابل و ارتباط آن با سبک رهبری تحول گرا و هوش سازمانی
-
بررسی تاثیر هویت سازمانی بر عملکرد سازمانی و مشتری مداری در صنعت بیمه (نمونه ی موردی: شرکت بیمه سامان)
-
بررسی تاثیر دسترسی به منابع مالی بر رابطه بین ارزش بازار شرکت و عوامل پیش بینی کنندگی بازده مازاد سهام
-
تاثیر استراتژی کسب و کار بر رابطه بین ریسک پذیری و ارزش شرکت
-
بررسی عملکرد سازه ی نامنظم قاب خمشی فولادی تحت فروریزش پیش رونده به روش های استاتیکی و دینامیکی غیرخطی
سوال خود را در مورد این مقاله مطرح نمایید :