-
hla typing from rna-seq sequence reads
جزئیات بیشتر مقاله- تاریخ ارائه: 1392/07/24
- تاریخ انتشار در تی پی بین: 1392/07/24
- تعداد بازدید: 1031
- تعداد پرسش و پاسخ ها: 0
- شماره تماس دبیرخانه رویداد: -
we present a method, seq2hla, for obtaining an individual’s human leukocyte antigen (hla) class i and ii typeand expression using standard next generation sequencing rna-seq data. rna-seq reads are mapped against areference database of hla alleles, and hla type, confidence score and locus-specific expression level aredetermined. we successfully applied seq2hla to 50 individuals included in the hapmap project, yielding 100%specificity and 94% sensitivity at a p-value of 0.1 for two-digit hla types. we determined hla type and expressionfor previously un-typed illumina body map tissues and a cohort of korean patients with lung cancer. because thealgorithm uses standard rna-seq reads and requires no change to laboratory protocols, it can be used for bothexisting datasets and future studies, thus adding a new dimension for hla typing and biomarker studies.
مقالات جدیدترین رویدادها
-
استفاده از تحلیل اهمیت-عملکرد در ارائه الگوی مدیریت خلاقیت سازمانی و ارائه راهکار جهت بهبود
-
بررسی تاثیر ارزش وجوه نقد مازاد بر ساختار سرمایه شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر سطح افشای ریسک بر قرارداد بدهی شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر رتبه بندی اعتباری مبتنی بر مدل امتیاز بازار نوظهور بر نقد شوندگی سهام با تأکید بر خصوصی سازی شرکت ها
-
تأثیر آمیخته بازاریابی پوشاک ایرانی بر تصویر ذهنی مشتری پوشاک ایرانی (هاکوپیان)
-
ارزیابی و رتبه بندی شاخص های کیفیت زندگی کاری با استفاده از رویکرد ترکیبی تحلیل شکاف و روش تاپسیس فازی
-
بررسی رابطه ی حمایت اجتماعی ادراک شده با سازگاری تحصیلی نوجوانان
-
مروری بر مدل های عددی دو بعدی انتقال آلودگی نفتی در آب های ساحلی
-
بازشناسی برون خط امضای فارسی مبتنی بر رویکرد ترکیب ویژگی ها و استفاده از ماشین بردار پشتیبان
-
an algorithm to simulate the one-dimensional superelastic cyclic behavior of niti strings, for civil engineering applications
مقالات جدیدترین ژورنال ها
-
مدیریت و بررسی افسردگی دانش آموزان دختر مقطع متوسطه دوم در دروان کرونا در شهرستان دزفول
-
مدیریت و بررسی خرد سیاسی در اندیشه ی فردوسی در ادب ایران
-
واکاوی و مدیریت توصیفی قلمدان(جاکلیدی)ضریح در موزه آستان قدس رضوی
-
بررسی تاثیر خلاقیت، دانش و انگیزه کارکنان بر پیشنهادات نوآورانه کارکنان ( مورد مطالعه: هتل های 3 و 4 ستاره استان کرمان)
-
بررسی تاثیر کیفیت سیستم های اطلاعاتی بر تصمیم گیری موفق در شرکتهای تولیدی استان اصفهان (مورد مطالعه: مدیران شرکتهای تولیدی استان اصفهان)
-
سنجش تاًثیر فناوری اطلاعات بر چابکی سازمانی با در نظر گرفتن اثر فرهنگ سازمانی
-
بررسی تلفیقی سازه ی دیاگرید و سیستم فتوولتائیک در جهت تأمین انرژی ساختمان های بلندمرتبه در منطقه آذربایجان ایران
-
اثربخشی بازخورد اصلاحی و انگیزه ای بر مسئولیت پذیری و اهمالکاری دانش آموزان پسر
-
مهارتهای زندگی از منظر قرآن
-
investigate the effect of services compensation system on employee performance in forensic of kohgiluyeh and boyerahmad province
سوال خود را در مورد این مقاله مطرح نمایید :