-
computational modeling and molecular dynamics simulations of thiazolino 2-pyridone amide analog compounds as chlamydia trachomatis inhibitor
جزئیات بیشتر مقاله- تاریخ ارائه: 1401/02/08
- تاریخ انتشار در تی پی بین: 1401/02/08
- تعداد بازدید: 96
- تعداد پرسش و پاسخ ها: 0
- شماره تماس ژورنال: 989360221112
computational modeling and molecular dynamics simulations of thiazolino 2-pyridone amide analog compounds as chlamydia trachomatis inhibitor
computer-aided drug screening by 2d-qsar, comfa, molecular docking, and molecular dynamics (md) simulation may provide an effective approach to identifying promising drug repurposing candidates for chlamydia trachomatis treatment. in this analysis, molecular descriptors were used to achieve a statistically momentous 2d-qsar model (r2 = 0.637; q2 = 0.5388).
the 2d-qsar model’s robustness was considered by the internal leave-one-out cross-validated regression coefficient values (q2) and the training set values [(r^2-r0^2)/r^2]. between the experimental and predicted pic50 value, the overall standard deviation error of prediction (sdep) was 0.2448, showing strong 2d-qsar model predictability. the qsar model was able to systematically predict anti-bacterial behavior with an r2pred value of 0.506 for the external data set 9 of the thiazolino 2-pyridone amide derivative.
comparative molecular field analysis (comfa (ffdsel) q2loo = 0.238, r2 = 0.943) and comfa (uvepls) (q2loo = 0.553, r2 = 0.943) were used. comfa (uvepls) had strong certification and prediction capabilities. we analyzed the binding effect of the derivatives, where compounds 29 and 31 have the least binding energy. compounds 29 and 31 interact with main active site residues, including glu154, leu142, his87, arg150, phe151, asn138, gly141, his88, ile137, cys85 and 145, respectively, through the binding interaction modes of the molecular docking inhibitor sequence.
further molecular dynamics simulations (md) were performed on both compounds, and their potential binding modes were explored. glu154, phe151, arg150, asn138, gly141, cys145, and ile137 have been found to play a key role in stabilizing inhibitors. besides, the prediction of a golden triangle for the series was carried out. the findings will provide useful guidance in the future for the design of new inhibitors of chlamydia trachomatis.
حوزه های تحت پوشش ژورنال
مقالات جدیدترین رویدادها
-
استفاده از تحلیل اهمیت-عملکرد در ارائه الگوی مدیریت خلاقیت سازمانی و ارائه راهکار جهت بهبود
-
بررسی تاثیر ارزش وجوه نقد مازاد بر ساختار سرمایه شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر سطح افشای ریسک بر قرارداد بدهی شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر رتبه بندی اعتباری مبتنی بر مدل امتیاز بازار نوظهور بر نقد شوندگی سهام با تأکید بر خصوصی سازی شرکت ها
-
تأثیر آمیخته بازاریابی پوشاک ایرانی بر تصویر ذهنی مشتری پوشاک ایرانی (هاکوپیان)
-
بررسی تاثیر مسئولیت اجتماعی شرکت بر عملکرد با تاکید بر نقش میانجی مدیریت منابع انسانی سبز در صنعت هتل داری
-
مطالعه ویژگی ها قوس بحرانی و رخدادهای پس از انهدام قوس پایدار در مصالح دانه ای به کمک دستگاه توسعه یافته دریچه
-
اصول و معیارهای طراحی معماری سبز با تاکید بر تکنولوژی بام سبز
-
بررسی آزمایشگاهی تعیین فرسایش پذیری سوسپانسیون ها، جهت تزریق در سازه های هیدرولیکی
-
ارزیابی شش مولفه ای رکورد زلزله های نزدیک گسل
مقالات جدیدترین ژورنال ها
-
مدیریت و بررسی افسردگی دانش آموزان دختر مقطع متوسطه دوم در دروان کرونا در شهرستان دزفول
-
مدیریت و بررسی خرد سیاسی در اندیشه ی فردوسی در ادب ایران
-
واکاوی و مدیریت توصیفی قلمدان(جاکلیدی)ضریح در موزه آستان قدس رضوی
-
بررسی تاثیر خلاقیت، دانش و انگیزه کارکنان بر پیشنهادات نوآورانه کارکنان ( مورد مطالعه: هتل های 3 و 4 ستاره استان کرمان)
-
بررسی تاثیر کیفیت سیستم های اطلاعاتی بر تصمیم گیری موفق در شرکتهای تولیدی استان اصفهان (مورد مطالعه: مدیران شرکتهای تولیدی استان اصفهان)
-
مقایسه تمایزیافتگی خود در نوجوانان با ساختارخانوادگی تک والد (والد-مادر) و خانواده هسته ای
-
ارتقا هویت یابی سازمانی از طریق برندسازی کارفرمایی (مورد مطالعه: شرکت کیسون)
-
بررسی سیر تاریخی شناخت علمی ادیان و پیدایش علم ملل و نحل در تاریخ و تمدن اسلامی برای همزیستی مسالمت آمیز
-
ارزیابی مؤلفه های تأثیرگذار بر جذب مشتریان و تمایل آن ها به خرید با تأثیرپذیری از سطح قدرت اجتماعی برند
-
the study of dissolution boric acid in different temperature conditions, the dft method
سوال خود را در مورد این مقاله مطرح نمایید :